精彩看点:速度起飞!替代 pandas 的八个神库
2022-08-03 17:55:45来源:Python爱好者社区
大家好,
之前介绍过不少关于pandas性能加速的技巧,但这些技巧再厉害,整体运行速度方面也会遇到瓶颈。
(资料图片仅供参考)
本篇介绍 8 个可以替代pandas的库,在加速技巧之上,再次打开速度瓶颈,大大提升数据处理的效率。
1. DaskDask在大于内存的数据集上提供多核和分布式并行执行。
在Dask中,一个DataFrame是一个大型且并行的DataFrame,由许多较小的 pandas DataFrames组成,沿索引拆分。
这些 pandas DataFrames 可以存在于单个机器上的磁盘中计算远超于内存的计算,或者存在集群中的很多不同机器上完成。一个 Dask DataFrame 操作会触发所有 Pandas DataFrames 的操作。
Dask-ML支持pandas、Numpy、Sklearn、XGBoost、XArray、RAPIDS等等,对于常用的数据处理、建模分析是完全够用的。
# 安装daskpip install dask# 导入dask dataframeimport dask.dataframe as dd
原理、使用可参考这篇:安利一个Python大数据分析神器Dask!
2. ModinModin是一个多进程的Dataframe库,可以加速Pandas的工作流程。多进程意味着,如果在多核的计算机上查询速度就会成倍的提升。
Modin具有与pandas相同的API,使用上只需在import导入时修改一下,其余操作一模一样。
# 导入 modin pandasimport modin.pandas as pd
原理、安装、使用可参考这篇:pandas慢怎么办?来试试Modin
3. Data TableDatatable是一个用于处理表格数据的 Python 库。
与pandas的使用上很类似,但更侧重于速度和大数据的支持。在单节点的机器上,无论是读取数据,还是数据转换等操作,速度均远胜于pandas。
如果不是分布式而是单节点处理数据,遇到内存不够或者速度慢,也不妨试试这个库。
使用文档:https://datatable.readthedocs.io/en/latest/start/quick-start.html4. PolarsPolars是使用 Apache Arrow Columnar Format 作为内存模型在 Rust 中实现的速度极快的 DataFrames 库。
# 安装 polarspip install polars# 导入 polarsimport polars as pl使用文档:https://pola-rs.github.io/polars-book/user-guide/index.html5. Vaex
Vaex 也是一个开源的 DataFrame,它采用内存映射、高效的核外算法和延迟计算等技术。
对于大数据集而言,只要磁盘空间可以装下数据集,使用Vaex就可以对其进行分析,解决内存不足的问题。
它的各种功能函数也都封装为类 Pandas 的 API,几乎没有学习成本。
可参考这篇文章:0.052 秒打开 100GB 数据,这个Python开源库火爆了!
6. PysparkPyspark 是 Apache Spark 的 Python API,通过分布式计算处理大型数据集。
# 安装pip install pyspark# 导入from pyspark.sql import SparkSession, functions as fspark = SparkSession.builder.appName("SimpleApp").getOrCreate()df = spark.read.option("header", True).csv("../input/yellow-new-yo
由于spark在速度上较hadoop更有优势,现在很多企业的大数据架构都会选择使用spark。
7. KoalasKoalas 是在 Apache Spark 之上实现 的pandas DataFrame API,让数据分析更高效。
由于 Koalas 是在 Apache Spark 之上运行的,因此还必须安装 Spark。
# 安装pip install pysparkpip install koalas# 导入import databricks.koalas as ksfrom pyspark.sql import SparkSession使用文档:https://koalas.readthedocs.io/en/latest/index.html8. cuDF
cuDF 是一个 Python GPU DataFrame 库,基于 Apache Arrow 列式内存格式构建,用于数据操作。
cuDF 提供类 pandas 的 API,因此数据分析师也是无需了解 CUDA 编程细节的。
import cudf, io, requestsfrom io import StringIOurl = "https://github.com/plotly/datasets/raw/master/tips.csv"content = requests.get(url).content.decode("utf-8")tips_df = cudf.read_csv(StringIO(content))tips_df["tip_percentage"] = tips_df["tip"] / tips_df["total_bill"] * 100print(tips_df.groupby("size").tip_percentage.mean())使用文档:https://github.com/rapidsai/cudf
本篇介绍的 8 个Python库原理不同,使用环境也有差异,大家可以根据自己的需求进行尝试。
但这些库基本上都提供了类pandas的API,因此在使用上没有什么学习成本,只要配置好环境就可以上手操作了。